مهمة مسار هندسة البرمجيات ضمن برنامج ماجستيرعلوم الحاسب هي توفير تعليم عالي الجودة في هندسة البرمجيات، يهدف لإعداد الطلبة في فلسطين ليكونوا مهندسي برمجيات أكفاء و رياديين، لديهم القدرة على تطوير أنظمة و حلول حاسوبية مبتكرة ذات موثوقية و كفاءة. و ذلك يتحقق من خلال تزويدهم بالمفاهيم والمعارف والمهارات الضرورية: بما في ذلك مهارات العمل الجماعي، و العمل ضمن فريق افتراضي عالمي، وأفضل ممارسات المهنة، والقدرة على مواصلة النمو مهنيا في هندسة البرمجيات. و هذا من شأنه أن يساعد في تطوير صناعة البرمجيات في فلسطين.