المعهد بتخصصاتة العلمية المختلفة يهدف إلى تحقيق العديد من الأمور، أهمها :

أولاً: تلبية لفلسفة الجامعة الوطنية بالاهتمام والمحافظة على الموروث الحضاري والذاكرة الفلسطينية في جوانبها المادية من خلال المبادرة في إجراء أبحاث ودراسات ميدانية اثرية وانثروبولوجية على مواقع اثرية وقرى تقليدية مختلفة في المجتمع الفلسطيني وربطها بمجال التطوير المجتمعي والسياحي

ثانياً: رفد المجتمع المحلي بكوادر مختصة في قطاع الاثار والصيانة والترميم  والفسيفساء وفق أسس علمية وتطبيقية حديثة تؤهلهم للالتحاق بمجالات العمل المختلفة في الحكومة ( وزارة السياحة والآثار) والقطاع الخاص

ثالثاً: توعية المجتمع المحلي بأهمية التراث الثقافي والطبيعي لحاضرهم ولمستقبل الأجيال القادمة ورفد النتائج المترتبة على الاعمال الميدانية بعناصر التراث الثقافي والهوية.